开发一个微信药店商城小程序，集成在线预约问诊、电子处方和ERP系统，是一个涉及多个技术层面的综合性项目。以下是一些关键步骤和注意事项：

目标用户：明确应用的目标用户群体，如患者、医生、药师等，了解他们的需求和偏好。

功能规划：列出应用需要实现的核心功能，包括药品展示、在线购买、在线预约问诊、电子处方生成与管理、ERP系统（库存管理、订单处理、财务管理等）。

合规性考虑：确保应用符合医疗行业相关法律法规要求，如数据保护、隐私政策、药品销售许可等。

前端技术：选择微信小程序作为开发平台，利用其丰富的组件和API进行快速开发。

后端技术：选择合适的后端框架（如Node.js、Java等）来构建服务器端逻辑，并确保与微信API的良好集成。

数据库：根据数据存储需求选择合适的数据库类型（如MySQL、MongoDB等），用于存储用户信息、药品信息、订单信息等。

实时通信：使用WebSocket或第三方服务（如Agora、腾讯云等）来实现在线问诊的实时通信功能。

界面设计：设计简洁美观的用户界面，提高用户体验。特别关注药品展示、搜索筛选、购物车等功能的易用性。

交互设计：优化操作流程，减少用户等待时间，提高用户满意度。例如，简化预约问诊流程，提供清晰的导航和提示信息。

商品模块：实现药品的展示、搜索、详情查看等功能。

购物车与结算：允许用户将药品加入购物车，并进行结算支付。

在线预约问诊：提供医生列表、预约时间选择、问诊记录查看等功能。

电子处方：支持医生在线开具电子处方，患者可查看和下载处方。

ERP系统：集成库存管理、订单处理、财务管理等ERP功能，实现药店内部管理的自动化和智能化。

功能测试：确保所有功能都能正常运行，无重大bug。特别注意测试在线支付、实时通信等关键功能的稳定性和安全性。

性能测试：优化应用的性能，提高加载速度和响应速度。特别是在高峰时段，确保系统能够稳定运行。

用户体验测试：邀请真实用户进行测试，收集反馈意见并进行改进。

提交审核：将应用提交至微信开放平台进行审核。确保应用符合微信平台的规范和要求。

营销推广：通过社交媒体、广告投放、合作推广等方式吸引用户下载和使用。同时，可以与医院、诊所等医疗机构合作，推广在线问诊和电子处方服务。

版本更新：定期发布新版本，修复已知问题，增加新功能。根据用户反馈和市场需求进行调整和优化。

用户反馈：关注用户反馈，及时解决用户遇到的问题。建立有效的客户支持体系，提供及时的帮助和支持。

数据分析：通过数据分析工具监控应用的使用情况，为后续优化提供依据。分析用户行为数据，了解用户需求和偏好，为营销提供支持。

合规性：确保应用内容符合医疗行业相关法律法规要求，避免涉及敏感话题和违规操作。

数据安全：保护用户隐私和数据安全，遵守相关法规要求。对敏感数据进行加密处理，防止数据泄露和滥用。

用户体验：始终将用户体验放在首位，不断优化应用以满足用户需求。关注用户反馈和市场需求变化，及时调整产品策略和方向。

请注意，以上信息仅供参考，具体开发过程可能因项目需求、团队能力等因素而有所不同。在进行开发前，建议咨询的软件开发公司或团队以获取更详细的指导和帮助。同时，医疗领域的应用开发还需特别注意行业规范和法律法规要求。