开发一个货运物流APP，包括快递同城配送和跑腿小程序系统，需要以下几个步骤：

1. 需求分析：明确APP的功能需求，例如订单管理、配送跟踪、支付功能等。同时，确定小程序的功能需求，如用户注册登录、下单、支付等功能。

2. 设计UI/UX界面：根据需求分析，设计APP和小程序的用户界面，确保用户体验良好。

3. 数据库设计：设计存储订单信息、用户信息、配送员信息等的数据库结构。

4. 后端开发：使用合适的编程语言（如Java、Python、PHP等）和框架（如Spring Boot、Django、Laravel等），实现后端逻辑，包括处理订单、配送员分配、支付等功能。

5. 前端开发：使用HTML、CSS和JavaScript等技术，实现APP和小程序的前端界面。可以使用流行的前端框架（如React Native、Flutter、Vue.js等）来提高开发效率。

6. API接口开发：为APP和小程序提供API接口，以便它们可以与后端进行通信。

7. 测试：对APP和小程序进行全面的测试，确保功能正常且无bug。

8. 上线发布：将APP和小程序发布到应用商店或平台，供用户下载和使用。

9. 运营和维护：持续收集用户反馈，优化产品功能，修复bug，并保持系统的稳定运行。

需要注意的是，开发这样的APP和小程序可能需要一定的技术和资金投入，建议在开始前进行详细的市场调研和技术评估。